Entre los objetivos principales del Parque Nacional Nahuel Huapi se encuentra el de conservar sus valores naturales y culturales.
Para ello se trabaja desarrollando distintos programas y proyectos, abordando las especies de animales y plantas, y sus ambientes, con la finalidad de que las decisiones de manejo se basen en el mejor conocimiento disponible, garantizando su perpetuidad a largo plazo.
En materia de prioridades los esfuerzos se orientan hacia aquellas problemáticas que requieren mayor atención, como las especies nativas de valor especial, el estado de conservación de los ambientes y las invasiones biológicas.
Los principales proyectos de conservación que se llevan adelante son:
